Hydrobiologický ústav (HBÚ) je jedním z ústavů sdružených v Biologickém centru Akademie věd České Republiky v Českých Budějovicích. Charakteristickým rysem HBÚ je vzájemné doplňování experimentální práce a terénního výzkumu s pravidelným dlouhodobým sledováním vybraných českých údolních nádrží, což umožňuje odlišení jevů nastávajících v různých časových měřítkách.