RNDr. Jan Mareš, Ph.D.

Funkce: Vědecký pracovník - Oddělení mikrobiální ekologie vody

Kontaktní údaje

Telefon: 387775886
E-mail: jan.mares@centrum.cz
Místnost: 032

Popis

Dlouhodobě se zabývám problematikou diverzity, rozšíření, ekologie a taxonomie sinic. Zejména se specializuji na objasnění molekulární fylogeneze a evoluce sinic, analýzu jejich genomů a genetického potenciálu pro syntézu toxinů a jiných biologicky aktivních látek. Kromě základního výzkumu se podílím též na výzkumu s potenciálem pro využití v praxi hydrobiologického monitoringu (identifikace druhů sinic, ekotoxikologický monitoring), a dále na charakterizaci nových přírodních produktů izolovaných ze sinic, potenciálně využitelných např. ve farmacii a zemědělství (antibiotika, fungicidy).

Odborný životopis

NAROZEN:  27. ledna 1984, Hradec Králové
 
VZDĚLÁNÍ:
• 2009–2015: Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, Přírodovědecká fakulta
                         Doktorský studijní program Botanika, specializace Fykologie
Disertační práce: Polyfázický přístup k taxonomii vybraných zástupců sinic.
 
ODBORNÉ ZÁJMY
Evoluce, taxonomie a rozšíření sinic (řas), molekulární fylogenetika, genomika a bioinformatika.
 
VĚDEČTÍ ZAMĚSTNAVATELÉ
• Biologické centrum AVČR, v.v.i., Hydrobiologický ústav (od r. 2014)
• Botanický ústav AVČR, v.v.i. (2011-2017)
• Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, Přírodovědecká fakulta (2010, od r. 2012)
• IMikrobiologický ústav AVČR, v.v.i. (od r. 2013)
 
OSTATNÍ ZAMĚSTNÁNÍ
• Povodí Vltavy, s.p. - hydrobiolog (2008 – 2012)

GRANTY

• 2022-2024 GA ČR 22-05478S: „Monopolizace příjmu železa nebo služba společenstvu? Dvě tváře sinicových betahydroxyaspartátových sideroforů“, spoluřešitel
• 2022-2024 GA ČR 22-06374S: „Sjednocení systematiky sinic pomocí harmonizace polyfázické a genomové taxonomie“, hlavní řešitel
• 2019-2021 GA ČR 19-21649J: „Lov na zabijáka orlů - výzkum cyanotoxinu způsobujícího ptačí vakuolární myelinopatii“, hlavní řešitel
• 2014-2016 GA ČR 16-09381S: „Bioactive cyanobacterial lipopeptides: genome mining, detection, and structure-activity relationships“, spoluřešitel
• 2014-2016 GA ČR 14-18067S „Toxic potential, evolution of toxin synthesis, and factors driving anatoxin-a production in benthic and soil nostocacean cyanobacteria“, člen týmu
• 2012-2014 MŠMT AMVIS/KONTAKT II LH12100 „ Diversity of cyanobacteria from tropical and subtropical biomas“, člen týmu
• 2012- 2014 GA ČR P506/12/1818 „Phylogenetic and phenotypic evaluation of heterocytous cyanobacteria from the family Scytonemataceae”, člen týmu
• 2011 doctoral grant of the Institute of Physical Biology (Univ. South Bohemia) "Multilocus sequence analysis as a tool for robust phylogeny in  heterocytous cyanobacteria", řešitel
• 2010 GA ČR 206/08/0318 „Phylogenetic relations, diversity and ecology of heterocytous cyanobacteria with polarised thalus”, člen týmu

Výuka Fykologické determinační praktikum (KBO/128 a KBO/129)
Jihočeská univerzita v Č. Budějovicích, Přírodovědecká fakulta
Popis:

Kurzy KBO/128 a KBO/129 jsou plánovány jako blokové, s 5ti denním pobytem v zajímavé algologické lokalitě. Poslední den pobytu je koncipován jako shrnující přednáška základních typů řas a sinic, které se na lokalitě vyskytovaly. Obsahem cvičení je determinace sinic a řas ve vzorcích z různých biotopů (toky a stojaté vody různých typů, aerofytická stanoviště), které student sám získá. Cílem je podstatně rozšířit determinační schopnosti studentů při práci se vzorky řas a sinic z nejrůznějších typů biotopů.

EN: Bloc courses of 5-day stay in an interesting algological site with determination of algal and cyanobacterial species.



Publikace
Celkem nalezeno: 39 záznamů
Bešta T., Mareš J., Čapková K., Janeček E., Štenclová L., Kust A., Říha M., Konopáčová E., Řeháková K. (2023) Littoral periphyton dynamics in newly established post‑mining lakes. Aquatic Sciences 85 : 21 .
DOI: 10.1007/s00027-022-00914-y
Čapková K., Bešta T., Mareš J., Čapek P., Řeháková K. (2022) A low-cost method of measuring the in situ primary productivity of periphyton communities of lentic waters. JoVE Journal of Visualized Experiments 190 : e64078.
DOI: 10.3791/64078
Masuda T., Inomura K., Mareš J., Prášil O. (2022) Crocosphaera watsonii. Trends in Microbiology 30 : 805-806.
DOI: 10.1016/j.tim.2022.02.006
Oren A., Mareš J., Rippka R. (2022) Validation of the names Cyanobacterium and Cyanobacterium stanieri, and proposal of Cyanobacteriota phyl. nov. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 72 : 005528.
DOI: 10.1099/ijsem.0.005528
Breinlinger S., Phillips T.J., Haram B.N., Mareš J., Martinez Yerena J., Hrouzek P., Sobotka R., Henderson W.M., Schmieder P., Williams S.M., Lauderdale J.D., Wilde H.D., Gerrin W., Kust A., Washington J.W., Wagner C., Geier B., Liebeke M., Enke H., Niedermeyer T.H.J., Wilde S.B. (2021) Hunting the eagle killer: A cyanobacterial neurotoxin causes vacuolar myelinopathy. Science 371 : 1335.
DOI: 10.1126/science.aax9050
Chen G.E., Hitchcock A., Mareš J., Gong Y., Tichý M., Pilný J., Kovářová L., Zdvihalová B., Xu J., Hunter C., Sobotka R. (2021) Evolution of Ycf54-independent chlorophyll biosynthesis in cyanobacteria. PNAS 118 : e2024633118.
DOI: doi.org/10.1073/pnas.2024633118
Galica T., Borbone N., Mareš J., Kust A., Caso A., Esposito G., Saurav K., Hájek J., Řeháková K., Urajová P., Costantino V., Hrouzek P. (2021) Cyanochelins, an overlooked class of widely distributed cyanobacterial siderophores, discovered by silent gene cluster awakening. Applied and Environmental Microbiology 87 : e03128-20.
DOI: 10.1128/AEM.03128-20
Hauerová R., Hauer T., Kaštovský J., Komárek J., Lepšová-Skácelová O., Mareš J. (2021) Tenebriella gen. nov. – The dark twin of Oscillatoria Molecular Phylogenetics and Evolution 165 : Article number 107293.
DOI: 10.1016/j.ympev.2021.107293
Němečková K., Culka A., Němec I., Edwards H.G.M., Mareš J., Jehlička J. (2021) Raman spectroscopic search for scytonemin and gloeocapsin in endolithic colonizations in large gypsum crystals. Journal of Raman Spectroscopy 52 : 2633–2647.
DOI: 10.1002/jrs.6186
Saha S., Bulzu P., Urajová P., Mareš J., Konert G., Manoel J.C., Macho M. , Ewe D., Hrouzek P., Masojídek J., Ghai R., Sourav K. (2021) Quorum-sensing signals from epibiont mediate the induction of novel microviridins in the mat-forming cyanobacterial genus Nostoc. mSphere 6 : e00562-21.
DOI: 10.1128/mSphere.00562-21
Jehlička J., Culka A., Mareš J. (2020) Raman spectroscopic screening of cyanobacterial chasmoliths from crystalline gypsum—The Messinian crisis sediments from Southern Sicily Journal of Raman Spectroscopy 51 : 1802-1812.
DOI: 10.1002/jrs.5671
Kust A., Řeháková K., Vrba J., Maicher V., Mareš J., Hrouzek P., Chiriac M., Benedová Z., Tesařová M., Saurav K. (2020) Insight into unprecedented diversity of cyanopeptides in eutrophic ponds using an MS/MS networking approach Toxins 12 : 561.
DOI: doi:10.3390/toxins12090561
Saha S., Esposito G., Urajová P., Mareš J., Ewe D., Caso A., Macho M. , Delawská K., Kust A., Hrouzek P., Juráň J. , Costantino V., Saurav K. (2020) Discovery of unusual cyanobacterial tryptophan-containing anabaenopeptins by MS/MS-based molecular networking Molecules 25 : 3786.
DOI: doi.org/10.3390/molecules25173786
Chmelík D., Hrouzek P., Fedorko J., Vu D. L., Urajová P., Mareš J., Červený J. (2019) Accumulation of cyanobacterial oxadiazine nocuolin A is enhanced by temperature shift during cultivation and is promoted by bacterial co-habitants in the culture Algal Research-Biomass Biofuels and Bioproducts 44 : 101673.
DOI: 10.1016/j.algal.2019.101673
Mareš J., Hájek J., Urajová P., Kust A., Jokela J., Saurav K., Galica T., Čapková K., Mattila A., Haapaniemi E., Permi P. , Mysterud I. , Skulberg O. M, Karlsen J., Fewer D. P. , Sivonen K., Tonnesen H. H. , Hrouzek P. (2019) Alternative Biosynthetic Starter Units Enhance the Structural Diversity of Cyanobacterial Lipopeptides Applied and Environmental Microbiology 85 : e02675-18.
DOI: 10.1128/AEM.02675-18
Mareš J., Johansen J., Hauer T., Zima J., Ventura S., Cuzman O., Tiribilli B., Kaštovský J. (2019) Taxonomic resolution of the genus Cyanothece (Chroococcales, Cyanobacteria), with a treatment on Gloeothece and three new genera, Crocosphaera, Rippkaea, and Zehria Journal of Phycology 55 : 578-610.
DOI: 10.1111/jpy.12853
Mareš J., Strunecký O., Bučinská L., Wiedermannová J. (2019) Evolutionary Patterns of Thylakoid Architecture in Cyanobacteria Frontiers in Microbiology 10 : 277.
DOI: 10.3389/fmicb.2019.00277
Pazderník M., Mareš J., Pilný J., Sobotka R. (2019) The antenna-like domain of the cyanobacterial ferrochelatase can bind chlorophyll and carotenoids in an energy-dissipative configuration Journal of Biological Chemistry 294 : 11131-11143.
DOI: 10.1074/jbc.RA119.008434
Kust A., Mareš J., Jokela J., Urajová P., Hájek J., Saurav K., Voráčová K., Fewer D., Haapaniemi E., Permi P., Řeháková K., Sivonen K., Hrouzek P. (2018) Discovery of a pederin family compound in a non-symbiotic bloom-forming cyanobacterium ACS Chemical Biology 13 : 1123-1129.
DOI: 10.1021/acschembio.7b01048
Kust A., Urajová P., Hrouzek P., Vu D. L., Čapková K., Štenclová L., Řeháková K., Kozlíková E., Lepšová-Skácelová O., Lukešová A., Mareš J. (2018) A new microcystin producing Nostoc strain discovered in broad toxicological screening of non-planktic Nostocaceae (cyanobacteria) Toxicon 150 : 66-73.
DOI: 10.1016/j.toxicon.2018.05.007

Více publikací

KONTAKT

Biologické centrum AV ČR, v.v.i.
Hydrobiologický ústav
Na Sádkách 702/7
370 05 České Budějovice

NAJÍT PRACOVNÍKA