RNDr. Jan Mareš, Ph.D.

Funkce: Vědecký pracovník - Oddělení mikrobiální ekologie vody

Kontaktní údaje

Telefon: 387775886
E-mail: jan.mares@centrum.cz
Místnost: 032

Popis

Dlouhodobě se zabývám problematikou ekologie a molekulární biologie sinic. Zejména se specializuji na objasnění molekulární fylogeneze a evoluce sinic, bioinformatickou analýzu jejich genomů a metagenomů z hlediska genetického potenciálu pro syntézu toxinů a jiných biologicky aktivních látek. Kromě základního výzkumu se podílím též na výzkumu s potenciálem pro využití v praxi hydrobiologického monitoringu (identifikace druhů sinic, ekotoxikologický monitoring), a dále na charakterizaci biosyntetických drah nových přírodních produktů izolovaných ze sinic, potenciálně využitelných např. ve farmacii a zemědělství.

ResearcherID: B-2395-2009; IF publikací: 70; citací: 2481 (citací bez autocitací: 2321), H-index: 25

Odborný životopis

NAROZEN: 27. ledna 1984, Hradec Králové

VZDĚLÁNÍ:
• 2009–2015: Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, Přírodovědecká fakulta
Doktorský studijní program Botanika, specializace Fykologie
Disertační práce: Polyfázický přístup k taxonomii vybraných zástupců sinic.

ODBORNÉ ZÁJMY
Evoluce, taxonomie a rozšíření sinic (řas), molekulární fylogenetika, genomika a bioinformatika, bioaktivní přírodní produkty.

VĚDEČTÍ ZAMĚSTNAVATELÉ
• Biologické centrum AVČR, v.v.i., Hydrobiologický ústav (od r. 2014)

• Mikrobiologický ústav AVČR, v.v.i. (od r. 2013)
• Botanický ústav AVČR, v.v.i. (2011-2017)
• Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, Přírodovědecká fakulta (2012-2023)

OSTATNÍ ZAMĚSTNÁNÍ

• Komunitní základní škola Starhill - průvodce (od r. 2024)

• Povodí Vltavy, s.p. - hydrobiolog (2008 – 2012)

GRANTY

• 2022-2024 GA ČR 22-05478S: „Monopolizace příjmu železa nebo služba společenstvu? Dvě tváře sinicových betahydroxyaspartátových sideroforů“, spoluřešitel
• 2022-2024 GA ČR 22-06374S: „Sjednocení systematiky sinic pomocí harmonizace polyfázické a genomové taxonomie“, hlavní řešitel
• 2019-2021 GA ČR 19-21649J: „Lov na zabijáka orlů - výzkum cyanotoxinu způsobujícího ptačí vakuolární myelinopatii“, hlavní řešitel
• 2014-2016 GA ČR 16-09381S: „Bioactive cyanobacterial lipopeptides: genome mining, detection, and structure-activity relationships“, spoluřešitel
• 2014-2016 GA ČR 14-18067S „Toxic potential, evolution of toxin synthesis, and factors driving anatoxin-a production in benthic and soil nostocacean cyanobacteria“, člen týmu
• 2012-2014 MŠMT AMVIS/KONTAKT II LH12100 „ Diversity of cyanobacteria from tropical and subtropical biomas“, člen týmu
• 2012- 2014 GA ČR P506/12/1818 „Phylogenetic and phenotypic evaluation of heterocytous cyanobacteria from the family Scytonemataceae”, člen týmu
• 2011 doctoral grant of the Institute of Physical Biology (Univ. South Bohemia) "Multilocus sequence analysis as a tool for robust phylogeny in heterocytous cyanobacteria", řešitel
• 2010 GA ČR 206/08/0318 „Phylogenetic relations, diversity and ecology of heterocytous cyanobacteria with polarised thalus”, člen týmu

Publikace

Celkem nalezeno: 56 záznamů
Delawská K., Hájek J., Voráčová K., Kuzma M., Mareš J., Vicková K., Kádek A., Tučková D., Gallob F., Divoká P., Moos M., Opekar S., Koch L., Saurav K., Sedlák D., Novák P., Urajová P., Dean J., Gažák R., Niedermeyer T.H.J., Kameník Z., Šimek P., Villunger A. , Hrouzek P. (2025) Discovery of nostatin A, an azole-containing proteusin with prominent cytostatic and pro-apoptotic activity. Organic & Biomolecular Chemistry 23 : 449-460. DOI: 10.1039/d4ob01395f
El-Tablawy N.H., Salem O.M.A., Štenclová L., Mareš J., Nikulin A.Y., Alwaili M.A., Albalwe F.M., Elkelish A., Cantonati M., Saber A.A. (2025) Morphotaxonomic, phylogenetic and phytochemical study of the invasive, green-tide-forming macroalga Ulva tepida (Chlorophyta) firstly recorded from the African-Mediterranean coastal waters. Aquatic Botany 198 : 103867. DOI: 10.1016/j.aquabot.2025.103867
Kiss É., Moos M., Mareš J., Opekar S., Tomanová L., Anindita P.D., Lukeš M., Urajová P., Sobotka R. (2025) Cyanophycinase is required for heterotrophy in cyanobacteria. Journal of Biological Chemistry 301 : 110791. DOI: 10.1016/j.jbc.2025.110791
Kozlíková E., Urajová P., Mareš J. (2025) Phylogenetic heterogeneity within the Cuspidothrix clade (Nostocales, Cyanobacteria): Dolichospermum longicellulare as a black sheep of its genus. Phycologia 64 : 346–354. DOI: 10.1080/00318884.2025.2545165
Vondrášková A., Hauer T., Mareš J., Berrendero-Gomez E., Zima J., Montoya-Terreros H., Villanueva C.D., Johansen J. (2025) Molecular characterization of the type species of Kyrtuthrix (Rivulariaceae, Cyanobacteriota) with comparison to Nunduva: Morphologically different but molecularly cryptic genera. Journal of Phycology 61 : 1274–1287. DOI: 10.1111/jpy.70063
Bohunická M. , Johansen J., Villanueva C.D., Mareš J., Štenclová L., Becerra–Absalón I., Hauer T., Kaštovský J. (2024) Revision of the pantropical genus Brasilonema (Nostocales, Cyanobacteria), with the description of 24 species new to science. Fottea 24 : 137–184. DOI: 10.5507/fot.2024.002
Masuda T., Mareš J., Shiozaki T., Inomura K., Fujiwara A., Prášil O. (2024) Crocosphaera watsonii – A widespread nitrogen-fixing unicellular marine cyanobacterium. Journal of Phycology 60 : 604–620. DOI: 10.1111/jpy.13450
Němečková K., Mareš J., Košek F., Culka A., Dudák J., Tymlová V., Žemlička J., Jehlička J. (2024) Comparative analysis of cyanobacterial communities in gypsum outcrops: insights from sites in Israel and Poland. Extremophiles 28 : 37. DOI: 10.1007/s00792-024-01352-4
Skotnicová P., Srivastava A., Aggarwal D., Talbot J., Karlínová I., Moos M., Mareš J., Bučinská L., Koník P., Šimek P., Tichý M., Sobotka R. (2024) A thylakoid biogenesis BtpA protein is required for the initial step of tetrapyrrole biosynthesis in cyanobacteria. New Phytologist 241 : 1236–1249. DOI: 10.1111/nph.19397
Bešta T., Mareš J., Čapková K., Janeček E., Štenclová L., Kust A., Říha M., Konopáčová E., Řeháková K. (2023) Littoral periphyton dynamics in newly established post‑mining lakes. Aquatic Sciences 85 : 21 . DOI: 10.1007/s00027-022-00914-y
Jehlička J., Culka A., Němečková K., Mareš J. (2023) Using Raman spectroscopy to detect scytonemin of epiliths and endoliths from marble, serpentinite and gypsum. Journal of Raman Spectroscopy 54 : 1280–1296. DOI: 10.1002/jrs.6514
Masuda T., Inomura K., Mareš J., Kodama T., Shiozaki T., Matsui T., Suzuki K., Takeda S., Deutsch C., Prášil O., Furuya K. (2023) Coexistence of dominant marine phytoplankton sustained by nutrient specialization. Microbiology Spectrum 11 : 1-14. DOI: 10.1128/spectrum.04000-22
Němečková K., Mareš J., Procházková L., Culka A., Košek F., Wierzchos J., Nedbalová L., Dudák J., Tymlová V., Žemlička J., Kust A., Zima J., Nováková E., Jehlička J. (2023) Gypsum endolithic phototrophs under moderate climate (Southern Sicily): their diversity and pigment composition. Frontiers in Microbiology 14 : 1175066. DOI: 10.3389/fmicb.2023.1175066
Schwark M., Martinez Yerena J., Röhrborn K., Hrouzek P., Divoká P., Štenclová L., Delawská K., Enke H., Vorreiter C., Wiley F., Sippl W., Sobotka R., Saha S., Wilde S.B., Mareš J., Niedermeyer T.H.J. (2023) More than just an eagle killer: The freshwater cyanobacterium Aetokthonos hydrillicola produces highly toxic dolastatin derivatives. PNAS 120 : e2219230120. DOI: 10.1073/pnas.2219230120
Štenclová L., Wilde S.B., Schwark M., Cullen J.L., McWhorter S.A., Niedermeyer T.H.J., Henderson W.M., Mareš J. (2023) Occurrence of aetokthonotoxin producer in natural samples – A PCR protocol for easy detection. Harmful Algae 125 : 102425. DOI: 10.1016/j.hal.2023.102425
Strunecký O., Ivanova A.P., Mareš J. (2023) An updated classification of cyanobacterial orders and families based on phylogenomic and polyphasic analysis. Journal of Phycology 59 : 12-51. DOI: 10.1111/jpy.13304
Sukačová K., Szotkowski M., Pařil P., Mareš J., Touš M., Vícha D., Polášek M., Márová I., Zavřel T. (2023) Simultaneous production of γ-linolenic acid and carotenoids by a novel microalgal strain isolated from the underexplored habitat of intermittent streams. Algal Research 71 : 103055. DOI: 10.1016/j.algal.2023.103055
Vondrák J., Svoboda S., Zíbarová L., Štenclová L., Mareš J., Pouska V., Košnar J., Kubásek J. (2023) Alcobiosis, an algal‑fungal association on the threshold of lichenisation. Scientific Reports 13 : 2957. DOI: 10.1038/s41598-023-29384-4
Čapková K., Bešta T., Mareš J., Čapek P., Řeháková K. (2022) A low-cost method of measuring the in situ primary productivity of periphyton communities of lentic waters. JoVE Journal of Visualized Experiments 190 : e64078. DOI: 10.3791/64078
Masuda T., Inomura K., Mareš J., Prášil O. (2022) Crocosphaera watsonii. Trends in Microbiology 30 : 805-806. DOI: 10.1016/j.tim.2022.02.006

Více publikací

RNDr. Jan Mareš, Ph.D.

KONTAKT

NAJÍT PRACOVNÍKA