RNDr. Daniel Bartoň, Ph.D.

Job Position: PhD student - Department of Fish and Zooplankton Ecology (FZE)

Contact details

Phone: +420 387 77 5855
E-mail: daniel.barton@hbu.cas.cz
Room: 326 NB

Description

My research focuses on the impacts of human activities on fish communities, particularly endangered and rheophilic species. I am especially interested in reproduction and early life stages, which are critical for maintaining viable populations. I study the effects of river regulation, hydropeaking, and biological invasions that threaten native fish species. I also address the issue of biodiversity decline and promote sustainable management in fishing grounds.

Curriculum vitae

Education
2018–2024 Ph.D. studies in Hydrobiology, Faculty of Science, University of South Bohemia, Branišovská 31, České Budějovice

2015–2018 M.Sc. in Animal Ecology, Faculty of Science, University of South Bohemia, Branišovská 31, České Budějovice

2011–2015 B.Sc. in Biology, Faculty of Science, University of South Bohemia, Branišovská 31, České Budějovice

Employment
2018–2024 – part-time position at the Biology Centre CAS, v. v. i.

since 2024 – full-time position at the Biology Centre CAS, v. v. i.

Scientific Projects
Principal Investigator
QL25020052 – Hodnocení biodiverzity, populačního stavu a hospodaření v mimopstruhových rybářských revírech. MZe NAZV, Země II (principal investigator, 2025–2027)

Co-Investigator
SS07010132 – Nová rizika přicházejí, avšak stará zůstávají: Vyhodnocení kontaminace bioty vod polutanty s možným dopadem na lidské zdraví včetně detekce cest vnosu z historických i aktuálních zdrojů. Modelový příklad povodí Ohře. TAČR Prostředí pro život (team member, 2024–2026)

24-11430K – Contamination of European aquatic ecosystems by organofluorine pollutants: levels and driving factors of bioaccumulation in the trophic web, GAČR (team member, 2024–2027)

BYCZ01-020 – Živé klenoty pod vodní hladinou Šumavy, INTERREG Bavaria – Czech Republic (team member, 2021–2027)

TJ02000012 – Zvýšení přirozeného reprodukčního potenciálu rheofilních ryb na člověkem ovlivněných tocích, TAČR (team member, 2019–2021)

QK1920326 – Akvakultura reofilních druhů ryb, GA MZe (team member, 2019–2021)

CZ.02.1.01/0.0/0.0/16_025/0007417 – Biomanipulace jako nástroj zlepšení kvality vody, OP VVV (team member, 2018–2022)

International Experience
2022 – Technical University of Munich, Aquatic Systems Biology Unit – Freising, Germany. Monitoring of fish passes on the Inn River, monitoring of invasive fish species in the Danube

Author Identifiers: WOS: AAD-2407-2021 | ORCID: 0000-0001-8042-4564

Total Publications: 29 | H-index: 10 | Total Citations: 240

Publications
Total found: 38 records
Symonová R., Jůza T., Tesfaye M., Brabec M., Bartoň D., Blabolil P., Draštík V., Kočvara L., Muška M., Prchalová M., Říha M., Šmejkal M., Souza A., Sajdlová Z., Tušer M., Vašek M., Skubic C., Kubečka J., Brabec J. (2025) Transition to piscivory seen through brain transcriptomics in a juvenile percid fish: Complex interplay of differential gene transcription, alternative splicing, and ncRNA activity. Journal of Experimental Zoology Part A: Ecological and Integrative Physiology 343 : 257–277.
DOI: 10.1002/jez.2886
Šmejkal M., Thomas K., Šmejkalová Z., Stepanyshyna Y., Bartoň D., Tapkir S., Meador Travis B., Vašek M. (2024) Isotopic niches reveal the impact of topmouth gudgeon and gibel carp on native crucian carp. NeoBiota 93 : 203-224.
DOI: 10.3897/neobiota.93.119274
Vejřík L., Vejříková I., Blabolil P., Bartoň D., Sajdlová Z., Kočvara L., Peterka J., Muška M., Duras J., Jůza T., Ribeiro F., Rivaes R., Ribeiro D., Castro B., Moncada M., Čech M. (2024) Long-lines for research monitoring and efficient population regulation of an invasive apex predator, European catfish (Silurus glanis). Heliyon 10 : e34125.
DOI: 10.1016/j.heliyon.2024.e34125
Vejřík L., Vejříková I., Sajdlová Z., Kočvara L., Kolařík T., Bartoň D., Jůza T., Blabolil P., Peterka J., Čech M., Vašek M. (2024) A non-lethal stable isotope analysis of valued freshwater predatory fish using blood and fin tissues as alternatives to muscle tissue. PLoS ONE 19 : e0297070.
DOI: 10.1371/journal.pone.0297070
Bartoň D., Sajdlová Z., Kolařík T., Kubečka J., Duras J., Kortan D., Šmejkal M. (2023) Use of a flow deflector to protect rheophilic fish spawning grounds during hydropeaking. River Research and Applications 39 : 561–569.
DOI: 10.1002/rra.4084
Blabolil P., Bartoň D., Duras J., Šmejkal M., Muška M. (2023) Rybí společenstvo vodní nádrže Láz v Brdech v roce 2020. [Fish community in the Láz water reservoir in the Brdy Highlands in 2020.] Bohemia centralis 38 : 191–202.
Ribeiro de Moraes K., Souza A., Bartoň D., Blabolil P., Muška M., Prchalová M., Randák T., Říha M., Vašek M., Turek J., Tušer M., Žlábek V., Kubečka J. (2023) Can a protected area help improve fish populations under heavy recreation fishing? Water 15 : 632.
DOI: 10.3390/w15040632
Říha M., Prchalová M., Brabec M., Draštík V., Muška M., Tušer M., Bartoň D., Blabolil P., Čech M., Frouzová J., Holubová M., Jůza T., Ribeiro de Moraes K., Rabaneda Bueno R., Sajdlová Z., Souza A., Šmejkal M., Vašek M., Vejřík L., Vejříková I., Peterka J., Kubečka J. (2023) Calibration of fish biomass estimates from gillnets: Step towards broader application of gillnet data. Ecological Indicators 153 : 110425.
DOI: 10.1016/j.ecolind.2023.110425
Šmejkal M., Bartoň D., Blabolil P., Kolařík T., Kubečka J., Sajdlová Z., Souza A., Brabec M. (2023) Diverse environmental cues drive the size of reproductive aggregation in a rheophilic fish. Movement Ecology 11 : 16.
DOI: 10.1186/s40462-023-00379-0
Šmejkal M., Bartoň D., Duras J., Horký P., Muška M., Kubečka J., Pfauserová N., Tesfaye M., Slavík O. (2023) Living on the edge: Reservoirs facilitate enhanced interactions among generalist and rheophilic fish species in tributaries. Frontiers in Environmental Science 11 : 1099030.
DOI: 10.3389/fenvs.2023.1099030
Thomas K., Brabec M., Tapkir S., Gottwald M., Bartoň D., Šmejkal M. (2023) Sampling bias of invasive gibel carp and threatened crucian carp: Implications for conservation. Global Ecology and Conservation 48 : e02718.
DOI: 10.1016/j.gecco.2023.e02718
Vejřík L., Vejříková I., Blabolil P., Sajdlová Z., Kočvara L., Kolařík T., Bartoň D., Jůza T., Šmejkal M., Peterka J., Čech M. (2023) Trophic position of the species and site trophic state affect diet niche and individual specialization: From apex predator to herbivore. Biology 12 : 1113.
DOI: 10.3390/biology12081113
Bartoň D., Brabec M., Sajdlová Z., Souza A., Duras J., Kortan D., Blabolil P., Vejřík L., Kubečka J., Šmejkal M. (2022) Hydropeaking causes spatial shifts in a reproducing rheophilic fish. Science of the Total Environment 806 : 150649.
DOI: 10.1016/j.scitotenv.2021.150649
Golpour Dehsari A., Šmejkal M., Čech M., Dos Santos R.A., Souza A., Jůza T., Martinez C., Bartoň D., Vašek M., Draštík V., Kolařík T., Kočvara L., Říha M., Peterka J., Blabolil P. (2022) Similarities and differences in fish community composition accessed by electrofishing, gill netting, seining, trawling, and water eDNA metabarcoding in temperate reservoirs. Frontiers in Ecology and Evolution 10 : 913279.
DOI: 10.3389/fevo.2022.913279
Nazarizadeh M., Peterka J., Kubečka J., Vašek M., Jůza T., Ribeiro de Moraes K., Čech M., Holubová M., Souza A., Blabolil P., Muška M., Tsering L., Bartoň D., Říha M., Šmejkal M., Tušer M., Vejřík L., Frouzová J., Jarić I., Prchalová M., Vejříková I., Štefka J. (2022) Different hosts in different lakes: occurrence and prevalence of Ligula intestinalis plerocercoids in Czech water bodies. Folia Parasitologica 69 : 18.
DOI: 10.14411/fp.2022.018
Nazarizadeh M., Peterka J., Kubečka J., Vašek M., Jůza T., Ribeiro de Moraes K., Čech M., Holubová M., Souza A., Blabolil P., Muška M., Tsering L., Bartoň D., Říha M., Šmejkal M., Tušer M., Vejřík L., Frouzová J., Jarić I., Prchalová M., Vejříková I., Štefka J. (2022) Different hosts in different lakes: occurrence and prevalence of Ligula intestinalis plerocercoids in Czech water bodies Folia Parasitologica 69 : 18.
DOI: 10.14411/fp.2022.018
Peterka J., Bartoň D., Blabolil P., Čech M., Draštík V., Holubová M., Jůza T., Kočvara L., Kolařík T., Kubečka J., Ribeiro de Moraes K., Prachař Z., Říha M., Sajdlová Z., Souza A. (2022) Biomanipulace na nádrži Jordán úspěšně otestována. Co bude dál? [Biomanipulation of the Jordán Reservoir successfully tested. What is going to follow?] Rybářství 4 : 48-51.
Říha M., Blabolil P., Kubečka J., Bartoň D., Souza A., Čech M., Draštík V., Holubová M., Kočvara L., Kolařík T., Ribeiro de Moraes K., Muška M., Prchalová M., Sajdlová Z., Soukalová K., Šmejkal M., Tušer M., Vašek M., Vejřík L., Vejříková I., Jůza T., Peterka J. (2022) Hodnocení vývoje ekologického potenciálu vybraných údolních nádrží z hlediska rybích obsádek. [Evaluation of the ecological potential development of selected water reservoirs in terms of fish stocks.] Vodní hospodářství 9 : 1-7.
Šmejkal M., Bartoň D., Brabec M., Sajdlová Z., Souza A., Ribeiro de Moraes K., Blabolil P., Vejřík L., Kubečka J. (2022) Behaviour affects capture probability by active sampling gear in a cyprinid fish. Fisheries Research 249 : 106267.
DOI: 10.1016/j.fishres.2022.106267
Tapkir S., Boukal D., Kalous L., Bartoň D., Souza A., Kolář V., Soukalová K., Duchet C., Gottwald M., Šmejkal M. (2022) Invasive gibel carp (Carassius gibelio) outperforms threatened native crucian carp (Carassius carassius) in growth rate and effectiveness of resource use: Field and experimental evidence. Aquatic Conservation: Marine and Freshwater Ecosystems 32 : 1901–1912.
DOI: 10.1002/aqc.3894

More publications

CONTACT

Biology Centre CAS
Institute of Hydrobiology
Na Sádkách 702/7
370 05 České Budějovice

Staff search