Job Position: Postdoc
-
Department of Fish and Zooplankton Ecology (FZE)
Phone:
+420 387 77 5855
E-mail:
daniel.barton@hbu.cas.cz
Room:
326 NB
My research focuses on the impacts of human activities on fish communities, particularly endangered and rheophilic species. I am especially interested in reproduction and early life stages, which are critical for maintaining viable populations. I study the effects of river regulation, hydropeaking, and biological invasions that threaten native fish species. I also address the issue of biodiversity decline and promote sustainable management in fishing grounds.
Education
2018–2024 Ph.D. studies in Hydrobiology, Faculty of Science, University of South Bohemia, Branišovská 31, České Budějovice
2015–2018 M.Sc. in Animal Ecology, Faculty of Science, University of South Bohemia, Branišovská 31, České Budějovice
2011–2015 B.Sc. in Biology, Faculty of Science, University of South Bohemia, Branišovská 31, České Budějovice
Employment
2018–2024 – part-time position at the Biology Centre CAS, v. v. i.
since 2024 – full-time position at the Biology Centre CAS, v. v. i.
Scientific Projects
Principal Investigator
QL25020052 – Hodnocení biodiverzity, populačního stavu a hospodaření v mimopstruhových rybářských revírech. MZe NAZV, Země II (principal investigator, 2025–2027)
Co-Investigator
SS07010132 – Nová rizika přicházejí, avšak stará zůstávají: Vyhodnocení kontaminace bioty vod polutanty s možným dopadem na lidské zdraví včetně detekce cest vnosu z historických i aktuálních zdrojů. Modelový příklad povodí Ohře. TAČR Prostředí pro život (team member, 2024–2026)
24-11430K – Contamination of European aquatic ecosystems by organofluorine pollutants: levels and driving factors of bioaccumulation in the trophic web, GAČR (team member, 2024–2027)
BYCZ01-020 – Živé klenoty pod vodní hladinou Šumavy, INTERREG Bavaria – Czech Republic (team member, 2021–2027)
TJ02000012 – Zvýšení přirozeného reprodukčního potenciálu rheofilních ryb na člověkem ovlivněných tocích, TAČR (team member, 2019–2021)
QK1920326 – Akvakultura reofilních druhů ryb, GA MZe (team member, 2019–2021)
CZ.02.1.01/0.0/0.0/16_025/0007417 – Biomanipulace jako nástroj zlepšení kvality vody, OP VVV (team member, 2018–2022)
International Experience
2022 – Technical University of Munich, Aquatic Systems Biology Unit – Freising, Germany. Monitoring of fish passes on the Inn River, monitoring of invasive fish species in the Danube
Author Identifiers: WOS: AAD-2407-2021 | ORCID: 0000-0001-8042-4564
Total Publications: 34 | H-index: 12 | Total Citations: 348 (278 without self-citation)
Bartoň D., Duras J., Kortan D.,
Šmejkal M. (2026) Dlouhodobý monitoring reprodukce bolena dravého: modelový příklad reofilní ryby v degradovaném prostředí. [] Ochrana přírody
81
: 20–23.
|
Bartoň D., Brabec J.,
Sajdlová Z.,
Blabolil P.,
Kubečka J.,
Šmejkal M. (2025) Cascade of dams amplifies predation risks for rheophilic fish eggs. Ecohydrology
18
: e70128.
DOI: 10.1002/eco.70128
|
Muška M., Bartoň D.,
Blabolil P.,
Tušer M., Luka V. (2025) Tajemství sekavce podunajského v Podtroseckých údolích. [The secret of the Danubian Spined Loach in the Podtrosecká údolí.] Živa
6
: 279-282.
|
Symonová R.,
Jůza T.,
Tesfaye M., Brabec M., Bartoň D.,
Blabolil P.,
Draštík V.,
Kočvara L.,
Muška M.,
Prchalová M.,
Říha M.,
Šmejkal M.,
Souza A.,
Sajdlová Z.,
Tušer M.,
Vašek M., Skubic C.,
Kubečka J., Brabec J. (2025) Transition to piscivory seen through brain transcriptomics in a juvenile percid fish: Complex interplay of differential gene transcription, alternative splicing, and ncRNA activity. Journal of Experimental Zoology Part A: Ecological and Integrative Physiology
343
: 257–277.
DOI: 10.1002/jez.2886
|
Thomas K., Brabec M., Kalous L., Gottwald M., Bartoň D., Grill S., Kořen V.,
Tapkir S.,
Šmejkal M. (2025) Anthropogenic induced drivers of fish assemblages in small water bodies and conservation implications. Ecohydrology & Hydrobiology
25
: 691–699.
DOI: 10.1016/j.ecohyd.2024.11.003
|
Thomas K., Kalous L., Brabec M., Velenský P., Gottwald M., Bartoň D.,
Tapkir S.,
Stepanyshyna Y.,
Šmejkalová Z.,
Šmejkal M. (2025) Participatory science to complement professional data: Towards conservation of declining native freshwater fish, the crucian carp. Ecological Solutions and Evidence
6
: e70055.
DOI: 10.1002/2688-8319.70055
|
Šmejkal M.,
Thomas K.,
Šmejkalová Z., Stepanyshyna Y., Bartoň D.,
Tapkir S., Meador Travis B.,
Vašek M. (2024) Isotopic niches reveal the impact of topmouth gudgeon and gibel carp on native crucian carp. NeoBiota
93
: 203-224.
DOI: 10.3897/neobiota.93.119274
|
Vejřík L.,
Vejříková I.,
Blabolil P., Bartoň D.,
Sajdlová Z.,
Kočvara L.,
Peterka J.,
Muška M., Duras J.,
Jůza T., Ribeiro F., Rivaes R., Ribeiro D., Castro B., Moncada M.,
Čech M. (2024) Long-lines for research monitoring and efficient population regulation of an invasive apex predator, European catfish (Silurus glanis). Heliyon
10
: e34125.
DOI: 10.1016/j.heliyon.2024.e34125
|
Vejřík L.,
Vejříková I.,
Sajdlová Z.,
Kočvara L.,
Kolařík T., Bartoň D.,
Jůza T.,
Blabolil P.,
Peterka J.,
Čech M.,
Vašek M. (2024) A non-lethal stable isotope analysis of valued freshwater predatory fish using blood and fin tissues as alternatives to muscle tissue. PLoS ONE
19
: e0297070.
DOI: 10.1371/journal.pone.0297070
|
Bartoň D.,
Sajdlová Z.,
Kolařík T.,
Kubečka J., Duras J., Kortan D.,
Šmejkal M. (2023) Use of a flow deflector to protect rheophilic fish spawning grounds during hydropeaking. River Research and Applications
39
: 561–569.
DOI: 10.1002/rra.4084
|
Blabolil P., Bartoň D., Duras J.,
Šmejkal M.,
Muška M. (2023) Rybí společenstvo vodní nádrže Láz v Brdech v roce 2020. [Fish community in the Láz water reservoir in the Brdy Highlands in 2020.] Bohemia centralis
38
: 191–202.
|
Ribeiro de Moraes K.,
Souza A., Bartoň D.,
Blabolil P.,
Muška M.,
Prchalová M., Randák T.,
Říha M.,
Vašek M., Turek J.,
Tušer M., Žlábek V.,
Kubečka J. (2023) Can a protected area help improve fish populations under heavy recreation fishing? Water
15
: 632.
DOI: 10.3390/w15040632
|
Říha M.,
Prchalová M., Brabec M.,
Draštík V.,
Muška M.,
Tušer M., Bartoň D.,
Blabolil P.,
Čech M.,
Frouzová J.,
Holubová M.,
Jůza T.,
Ribeiro de Moraes K.,
Rabaneda Bueno R.,
Sajdlová Z.,
Souza A.,
Šmejkal M.,
Vašek M.,
Vejřík L.,
Vejříková I.,
Peterka J.,
Kubečka J. (2023) Calibration of fish biomass estimates from gillnets: Step towards broader application of gillnet data. Ecological Indicators
153
: 110425.
DOI: 10.1016/j.ecolind.2023.110425
|
Šmejkal M., Bartoň D.,
Blabolil P.,
Kolařík T.,
Kubečka J.,
Sajdlová Z.,
Souza A., Brabec M. (2023) Diverse environmental cues drive the size of reproductive aggregation in a rheophilic fish. Movement Ecology
11
: 16.
DOI: 10.1186/s40462-023-00379-0
|
Šmejkal M., Bartoň D., Duras J., Horký P.,
Muška M.,
Kubečka J., Pfauserová N.,
Tesfaye M., Slavík O. (2023) Living on the edge: Reservoirs facilitate enhanced interactions among generalist and rheophilic fish species in tributaries. Frontiers in Environmental Science
11
: 1099030.
DOI: 10.3389/fenvs.2023.1099030
|
Thomas K., Brabec M.,
Tapkir S., Gottwald M., Bartoň D.,
Šmejkal M. (2023) Sampling bias of invasive gibel carp and threatened crucian carp: Implications for conservation. Global Ecology and Conservation
48
: e02718.
DOI: 10.1016/j.gecco.2023.e02718
|
Vejřík L.,
Vejříková I.,
Blabolil P.,
Sajdlová Z.,
Kočvara L.,
Kolařík T., Bartoň D.,
Jůza T.,
Šmejkal M.,
Peterka J.,
Čech M. (2023) Trophic position of the species and site trophic state affect diet niche and individual specialization: From apex predator to herbivore. Biology
12
: 1113.
DOI: 10.3390/biology12081113
|
Bartoň D., Brabec M.,
Sajdlová Z.,
Souza A., Duras J., Kortan D.,
Blabolil P.,
Vejřík L.,
Kubečka J.,
Šmejkal M. (2022) Hydropeaking causes spatial shifts in a reproducing rheophilic fish. Science of the Total Environment
806
: 150649.
DOI: 10.1016/j.scitotenv.2021.150649
|
Golpour Dehsari A.,
Šmejkal M.,
Čech M., Dos Santos R.A.,
Souza A.,
Jůza T.,
Martinez C., Bartoň D.,
Vašek M.,
Draštík V.,
Kolařík T.,
Kočvara L.,
Říha M.,
Peterka J.,
Blabolil P. (2022) Similarities and differences in fish community composition accessed by electrofishing, gill netting, seining, trawling, and water eDNA metabarcoding in temperate reservoirs. Frontiers in Ecology and Evolution
10
: 913279.
DOI: 10.3389/fevo.2022.913279
|
Nazarizadeh M.,
Peterka J.,
Kubečka J.,
Vašek M.,
Jůza T.,
Ribeiro de Moraes K.,
Čech M.,
Holubová M.,
Souza A.,
Blabolil P.,
Muška M., Tsering L., Bartoň D.,
Říha M.,
Šmejkal M.,
Tušer M.,
Vejřík L.,
Frouzová J.,
Jarić I.,
Prchalová M.,
Vejříková I., Štefka J. (2022) Different hosts in different lakes: occurrence and prevalence of Ligula intestinalis plerocercoids in Czech water bodies. Folia Parasitologica
69
: 18.
DOI: 10.14411/fp.2022.018
|
More publications
