Projekty

Mezinárodní projekty

Spanish Ministry of Environment, in the frame of the cooperative research programme called “PROGRAMA NACIONAL DE INVESTIGACIÓN CIENTÍFICA, DESARROLLO E INNOVACIÓN TECNOLÓGICA”

Portorické oddělení pro přírodní a ekologické zdroje

Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy

Landesamt für Verbraucherschutz, Landwirtschaft und Flurneuordnung Frankfurt/O., Germany

EU Horizon 2020

EHP a Norské fondy

 

Česko-Norský výzkumný program (CZ09)


Národní projekty

Technologická agentura ČR

Grantová Agentura ČR

Grantová agentura Akademie věd ČR

Akademie věd ČR


Spanish Ministry of Environment, in the frame of the cooperative research programme called “PROGRAMA NACIONAL DE INVESTIGACIÓN CIENTÍFICA, DESARROLLO E INNOVACIÓN TECNOLÓGICA”

Calibration of sampling methods for Spanish fish populations in reservoirs

Číslo projektu: PROFIT

Řešitel: Jan Kubečka

Spoluřešitel: ECOHYDROS, S.L., Spain, Department of Ecology of the Universidad de Sevilla, Spain

Zdroj financování: Spanish Ministry of Environment, in the frame of the cooperative research programme called “PROGRAMA NACIONAL DE INVESTIGACIÓN CIENTÍFICA, DESARROLLO E INNOVACIÓN

Doba řešení: 2009-2010

Základní průzkumy dvou španělských nádrží nejnovějšími českými i evropskými metodikami.


Portorické oddělení pro přírodní a ekologické zdroje

Podpora a management sladkovodních sportovních druhů ryb

Číslo projektu: 2010-001577

Řešitel: J. Wesley Neal, Robert Kroger, Craig G. Lilyestrom

Spoluřešitel: Marie Prchalová

Zdroj financování: Portorické oddělení pro přírodní a ekologické zdroje

Doba řešení: 2009-2011

Výzkum i managementová rozhodnutí ohledně okounka pstruhového Micropterus salmoides na Portoriku se opírají o předpoklad, že dostupnost potravy nepředstavuje limitující faktor, avšak přesvědčivá data na toto téma nejsou k dispozici. Drobná rybka Dorosoma petenense je základním potravním druhem pro sportovní ryby v portorických nádržích, ale přímý výzkum dosud nikdy nekvantifikoval početnost nebo roční produkci tohoto druhu. Tento druh se nejspíš rozmnožuje celý rok, avšak rozsah reprodukce není znám. Vzhledem k tomu, že efektivní management okounka pstruhové vyžaduje úvahy o predátorech i jejich kořisti, měli bychom lépe porozumět populační dynamice kořisti v nádržích Portorika. Tato část projektu sestává ze dvou částí – porovnání aktivních a pasivních odlovných prostředků pro vzorkování početnosti populací kořisti v portorických nádržích a populační dynamika kořisti na Portoriku.


Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy

Centrum pro ekologický potenciál rybích obsádek nádrží a jezer

Číslo projektu: CZ.1.07/2.3.00/20.0204

Řešitel: Josef Matěna, Jan Kubečka

Zdroj financování: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy

Doba řešení: 2012–2015

Rybí společenstva nádrží a jezer ma jí genofondovou, ekologickou a ekonomickou hodnotu a podstatný vliv na kvalitu vody. Projekt umožní podpořit špičkový tým pro syntézu uvedených významů a pro definici ekologického potenciálu rybích obsádek. Počítá se se zdokonalením a rozšířením současných metod studia a s průzkumy nejzajímavějších
nádrží ČR. Zároveň se propojí tuzemské aktivity s evropskými iniciativami a zviditelní usilovné snažení české limnologické školy o skutečně pravdivé poznání rybích obsádek a jejich role v ekosystému. Komplexní vymezení ekologického potenciálu (faunistická, rybářsko-produkční a biomanipulační hodnota, vyváženost populační dynamiky a
trofických vztahů) bude možné díky rozšíření tuzemských lidských zdrojů, podpoře stáží na špičkových pracovištích, integrace do evropských struktur a spolupráci se zahraničním expertem. Projekt podpoří rozvoj regionu, prestiž české vědy i vodohospodářský management.


Landesamt für Verbraucherschutz, Landwirtschaft und Flurneuordnung Frankfurt/O., Germany

Estimation of fish yield potential in lakes, fish assessment in Lake Werbellinsee

Číslo projektu: No. 09-14

Řešitel: Jan Kubečka

Spoluřešitel: Institut für Binnenfischerei e.V. Potsdam-Sacrow

Zdroj financování: Landesamt für Verbraucherschutz, Landwirtschaft und Flurneuordnung Frankfurt/O., Germany

Doba řešení: 2009-2010

The investigations were be carried out on Lake Werbellinsee in September 2009 by using the following methods:

1) Hydroacoustic survey by scientific echosounder (two day and night surveys)

2) Survey of the open water fish by fry trawls (approximately 20 trawlings by 3x3 m trawl)

The emphasis of the survey work was on the population assessment (abundance, spatial and vertical distribution, species and size composition) of vendace (Coregonus albula)
and smelt (Osmerus eperlanus).


EU Horizon 2020

Co-creating a decision support framework to ensure sustainable fish production in Europe under climate change (ClimeFish)

Číslo projektu: 677039

Řešitel: Prof. Michaela Aschan, University of Tromso, Norway

Spoluřešitel: Prof. Jan Kubečka, Ph.D.

Zdroj financování: EU Horizon 2020

Doba řešení: 2016-2020

Scientist from 16 countries join forces to help ensure that the increase in seafood production comes in areas and for species where there is a potential for sustainable growth, given the expected climate changes. In ClimeFish they will provide a support framework for decision makers, thus contributing to robust employment and sustainable development of rural and coastal communities. In Czech part of the project we intend to rationalize the angling use of fish production under changing environment.

Why: Climate changes are real, they are happening right now and they are threatening sustainable growth in aquaculture and fisheries worldwide. The world population is growing, and the demand for food is increasing. Forecasts indicate an overall decline in food production due to climate change. ClimeFish addresses the necessity of changes, both when it comes to utilizing opportunities and mitigating risks under climate change. ClimeFish will help ensure that the increase in seafood production comes in areas and for species where there is a potential for sustainable growth. In Czech conditions the growth of production is complicated by the changes of nutrient concentrations and angling effort. All these factors will be considered.

What: ClimeFish will provide guidelines for how to make climate-enabled management plans to prepare and adapt to climate change while minimizing economic losses and social consequences. Thus, based on the expected climatic challenges, ClimeFish will contribute to robust employment and sustainable development of rural and coastal communities. The output of the project will be the ClimeFish Decision Support Framework (DSF), which contains guidelines, databases and the ClimeFish Decision Support System (DSS). The results of the project will be used for optimization of fishery in Lipno reservoir and other waterbodies.

How: ClimeFish will develop forecasts for production scenarios that will serve as input to socio-economic analysis and identify risks and opportunities regarding climate changes. Strategies to mitigate risk and utilize opportunities will be identified in co-creation with stakeholders, and will serve to strengthen the scientific advice and to improve long term production planning and policymaking. The project addresses three production sectors: marine aquaculture, marine fisheries and lake and pond production in a total of 16 case studies, involving more than 25 species. For Czech fisheries, the main target species are wells, Silurus glanis, pikeperch, Sander lucioperca and carp, Cyprinus carpio.

ClimeFish


EHP a Norské fondy

Monitoring of the fish stock of Czech reservoirs

Číslo projektu: CZ0091

Řešitel: Jan Kubečka:

Zdroj financování: EHP a Norské fondy

Doba řešení: 2008-2010

The project is aimed at improvement of ecological potential of Czech reservoirs and enhancement of fisheries management by improving the methods of assessment of qualitative and quantitative composition of the fish stock. The project includes introduction of active methods of monitoring, namely new hydroacoustic and trawling approaches. Active methods should mitigate the main weaknesses of the current monitoring based predominantly on passive methods.Managing of the use of active trawling gear for fish capture would represent the revolution both in monitoring and the management of reservoirs. The project follows the philosophy of the EC water framework directive 2000/60/EC and promises to create new fish monitoring methodology and to bring new crucial knowledge to the methods of fish capture in general.


Monitoring the environment of man-made lakes: what can fisheries data and models tell us?

Číslo projektu: A/CZ0046/2/0029

Řešitel: David Boukal

Spoluřešitel: Jan Kubečka

Zdroj financování: EHP a Norské fondy

Doba řešení: 2009-2010

Research and development of a comprehensive database on fish population dynamics and history of exploitation in selected man-made reservoirs in the Czech Republic. Development of mathematical models to identify exploitation strategies that take into account stakeholder interests along with the ecological and evolutionary consequences of the exploitation, with the aim to identify the 'best' strategies and identify data/parameters/processes whose measurement can greatly improve the quality of the monitoring of the status of fish stocks in Czech man-made reservoirs. Communication of the main scientific findings to the key stakeholders identified during this study.


Česko-Norský výzkumný program (CZ09)

Vliv submerzních makrofyt na trofické vazby a distribuci ryb v hlubokých jezerech (MacFish)

Číslo projektu: 7F14316

Řešitel: Jiří Peterka

Spoluřešitel: Karl Oysten Gjelland, Norwegian Institute for Nature Research

Zdroj financování: Česko-Norský výzkumný program (CZ09)

Doba řešení: 2014-2017

Predace rybami je primární strukturující silou ve vodních ekosystémech (tzv. kontrola shora). Změny v interakcích predátor-kořist mohou kaskádovým efektem ovlivnit jednotlivé úrovně potravního řetězce, což může následně vyústit v posun ekosystému z jednoho stavu do jiného. Submerzní makrofyta mají vedle zásadní úlohy primárních producentů i zásadní roli ve strukturování sladkovodních společenstev. Protože jsou ale svým výskytem vázaná zejména na malá a mělká jezera s nedostatkem či absencí hlubokovodních refugií, upínala se vědecká pozornost zejména k těmto systémům a znalost vlivů makrofyt na společenstva hlubokých vodních těles zůstala doposud nedostatečná. Cílem tohoto projektu je zásadním způsobem obohatit dosavadní znalosti o mechanismech, kterými submerzní makrofyta ovlivňují společenstva ryb v hlubokých jezerech. Problematika bude řešena srovnáním struktury a dynamiky rybích společenstev, dvou nově vzniklých jezer s podobnou velikostí a sukcesní historií, ale s odlišným výskytem submerzních makrofyt. Využívání různých typů prostředí a zjištění vzorců aktivity nejvýznamnějších druhů ryb v rámci společenstva bude provedeno primárně s využitím nejmodernějších telemetrických metod, které budou doplněny o další metody vzorkování jako je echolokace, akustické a optické kamery, elektrolov, tralování a odlov tenatními sítěmi. Důraz bude kladen na šetrnost odlovných metod a pokrytí veškerých vývojových stádií od larev až po dospělce. Individuální pozice v potravních sítích bude zjišťována na základě rozboru obsahu zažívadel a analýzy stabilních izotopů. Získaná data budou použita k vyhodnocení vnitro- a mezidruhových překryvů ve využívání prostorové a potravní niky, stejně jako vzorců aktivity nahlížených s velkým časoprostorovým rozlišením. V kombinaci s odhady potravních nároků piscivorních ryb a životními charakteristikami jako je růst a věk dosažení pohlavní zralosti u kořisti, bude dosažen ucelený a detailní vhled do mechanismů jakými submerzní makrofyta ovlivňují strukturu rybích společenstev. Projekt poskytne zásadní nové poznatky, které najdou uplatnění při obnově a řízení vodních těles, a též značně posílí spolupráci a transfer znalostí mezi českými a norskými institucemi zabývajícími se výzkumem vodních ekosystémů.


Technologická agentura ČR

Sedimenty vodních děl - identifikace, kvantifikace, chrakterizace, sanace - nové postupy

Číslo projektu: TA04021342

Řešitel: Jakub Borovec

Zdroj financování: Technologická agentura ČR

Doba řešení: 2015 - 2017


Grantová Agentura ČR

Rybníky jako modely pro studium diversity a dynamiky planktonu hypetrofních mělkých jezer

Číslo projektu: 17-09310S

Řešitel: Jaroslav Vrba, Přírodovědecká fakulta, Jihočeská Univerzita v Českých Budějovicích

Spoluřešitel: Jiří Nedoma

Zdroj financování: Grantová Agentura ČR

Doba řešení: 2017 - 2019

Cílem projektu je prozkoumat diverzitu a dynamiku planktonu, hlavní zástupce a jejich funkční vlastnosti, a stanovit primární produkci, respiraci, mobilizaci živin a účinnost produkce v hypertrofních rybnících, což umožní testovat a zpřesnit s tím spojené obecné ekologické hypotézy.

Rybníky jsou přírodě blízké, člověkem řízené, mělké ekosystémy využívané k produkci ryb. Rozdílné hospodaření navozuje různé ekologické situace, což z rybníků činí unikátní modelové ekosystémy. Přísun živin a vysoké rybí obsádky způsobily, že mnoho rybníků dosahuje hypertrofie, avšak znalosti o interakcích v planktonu za těchto podmínek jsou nedostatečné. Chybí údaje o úrovni primární produkce, intenzitě respirace i diverzitě a funkci heterotrofních mikrobiálních potravních sítí v živinami přetížených vodách, stejně jako o vlivu ryb na strukturu těchto sítí. Budeme testovat hypotézy, že v hypertrofních podmínkách se prohlubuje heterotrofní charakter ekosystému, roste podíl heterotrofní mikrobiální biomasy a mobilizace živin, snižuje se čistá produkce a klesá efektivita využívání živin rybami. Intenzivní fotosyntéza a respirační procesy v podmínkách vysoké mikrobiální (auto- i heterotrofní) biomasy zvyšují nestabilitu systému a způsobují nízkou účinnost produkce, což vede k vyšší diverzitě (zejména mikrobiální) planktonu díky nárůstu počtu nových nik.


Dynamika fosforu v neobhospodařovaných terestrických ekosystémech: Vztahy s cykly dusíku a uhlíku.

Číslo projektu: 17-15229S

Řešitel: Jiří Kopáček

Spoluřešitel: Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, Př.F.

Zdroj financování: Grantová Agentura ČR

Doba řešení: 2017 - 2019

Středoevropské neobhospodařované horské ekosystémy Šumavy a Vysokých Tater se v současnosti zotavují z atmosférické acidifikace nejrychleji na světě. Související změny biogeochemických procesů a cyklů živin (P, N a C) v půdách jsou ale ovlivněny rychle se měnícím klimatem a stavem vegetace. Výsledkem jejich společného působení jsou nežádoucí ztráty živin z půd a jejich odnos do vodních ekosystémů. Rozsah a rychlost ztrát živin a znečišťování vod se liší mezi jednotlivými povodími vlivem složení půd a podloží a v závislosti na zdravotním stavu vegetace. Na základě dlouhodobého výzkumu těchto povodí navrhujeme integrované laboratorní a in situ experimenty cílené na studium vlivu měnících se chemických, klimatických a vegetačních podmínek na (1) mikrobiální společenstva půd v lokalitách s odlišnými zdroji a dostupností P, (2) cyklus P v půdách a jeho propojení s cykly C a N, zejména vliv dostupnosti P na saturaci povodí dusíkem a roli organického C na vyplavování P, (3) rychlost zvětrávání a uvolňování P z podloží a minerálních půd, a (4) znečišťování vod touto klíčovou živinou.


Objasnění životních strategií sladkovodních virů pomoci metagenomiky

Číslo projektu: 17-04828S

Řešitel: Rohit Ghai

Zdroj financování: Grantová Agentura ČR

Doba řešení: 2017 - 2019

Viry jsou nejhojnější biologické entity na planetě, nejméně o jeden řád početnější než jejich mikrobiální hostitelé ve vodním prostředí. Přes jejich hojnost zůstává studium virů pomocí kultivace s izolovanými mikroorganismy výzvou, a to vzhledem ke složitosti získávání axenických kultur významných mikrobiálních skupin. Tato situace je ještě zajímavější ve sladkých vodách, kde je dostupnost těchto axenických kultur stále poměrně omezená. Navrhujeme dlouhodobý metagenomický přístup založený na dvou dobře prozkoumaných sladkovodních nádržích. Cílem je umožnit prvotní pohled na významné bakteriofágy s dvouřetězcovou DNA ve sladkých vodách. Chceme propojit tyto fágy, které zatím nemáme v kultivacích, s jejich hostitelem, a to jak pomocí stávajících přístupů založených na sekvencích, tak pomocí nových metod, které sami vyvineme. Především se zaměříme na životní strategie volně žijících virů a jejich vývoj při soužití s hostitelskými mikroby. Kromě toho očekáváme nové poznatky o faktorech, které ovlivňují sezónní dynamiku a globální biogeografii fágů a hostitelských populací.


Bioaktivní sinicové lipopeptidy: analýza genomových dat, detekce a vztah struktury a biologické aktivity

Číslo projektu: 16-09381S

Řešitel: RNDr. Pavel Hrouzek Ph.D., Institute of Microbiology, CAS

Spoluřešitel: RNDr. Jan Mareš Ph.D., Biology Centre CAS, Institute of Hydrobiology

Zdroj financování: Grantová Agentura ČR

Doba řešení: 2016 - 2018

Projekt je zaměřen na detekci bioaktivních lipopeptidů a genů pro syntézu lipopeptidů v sinicích. Sinice potenciálně produkující lipopeptidy budou identifikovány na základě průzkumu genomových databází. Následně budou navrženy a testovány metody pro molekulární (PCR) a chemickou detekci lipopeptidů v laboratorních kmenech a environmentálních vzorcích sinic. Bioaktivita lipopeptidů bude zjišťována pomocí in vitro testů na lidských rakovinných buněčných liniích a fytopatogenních houbách. Lipopeptidy vykazující silnou bioaktivitu budou purifikovány a bude objasněna jejich chemická struktura. Bude zhodnocen vztah chemické struktury k bioaktivním účinkům a možné využití pro farmaceutické a biotechnologické účely. U kmenů produkujících nejzajímavější látky, avšak dosud postrádajících genomová data, bude provedeno celogenomové sekvenování. To nám umožní identifikovat nové genové klastry pro syntézu lipopeptidů a predikovat průběh jejich biosyntézy. Dále bude zkoumána fylogenetická a environmentální distribuce sinic produkujících lipopeptidy a evoluce genů pro syntézu lipopeptidů.


Charakteristiky životních strategií vybraných skupin Betaproteobacteria ve vztahu k jejich roli v přenosu uhlíku do vyšších trofických hladin

Číslo projektu: 13-00243S

Řešitel: Karel Šimek

Zdroj financování: Grantová Agentura ČR

Doba řešení: 2013 - 2017

Navrhujeme výzkum životních strategií bakterií a charakteristik genomu reprezentativních kmenů ze dvou klíčových skupin Betaproteobacteria, rodu Limnohabitans a rodu Polynucleobacter, jejichž ekofyziologické vlastnosti a pro ně typická vodní prostředí jsou velmi odlišná. Předpokládáme, že různé druhy těchto skupin bakterií, které jsou početné v přírodních vodách, se liší jak růstových potenciálem, tak i rychlostí, s jakou jsou pohlcovány bičíkovci. Právě interakce bakterie – fagotrofní bičíkovci také významně ovlivňuje jejich roli v toku uhlíku do vyšších trofických úrovní. Úspěšně jsme izolovali velkou sbírku kmenů z obou cílových skupin bakterií, která umožní studium jejich diverzity, ekologických a genomických charakteristik. Navrhujeme soubor specifických in situ pokusů, které usnadní testovat fyziologické charakteristiky a přenos uhlíku z testových skupin (ale i z jednotlivých kmenů) bakterií do bičíkovců v pěti různých nádržích a jezerech. Tato data přinesou nové náhledy do životních strategií planktonních bakterií a umožní i určitou revizi jejich současných konceptů.


Odrážejí dlouhodobá data o zooplanktonu Slapské nádrže civilizační nebo klimatické změny v minulých 50 letech?

Číslo projektu: 15-04034S

Řešitel: Jaroslav Vrba, Přírodovědecká fakulta, Jihočeská Univerzita v Českých Budějovicích

Spoluřešitel: Josef Hejzlar

Zdroj financování: Grantová Agentura ČR

Doba řešení: 2015 - 2017


Dlouhodobý vliv redukce ryb na perloočky rodu Daphnia ve velké nádrži

Číslo projektu: 15-24309S

Řešitel: Jaromír Seďa

Zdroj financování: Grantová Agentura ČR

Doba řešení: 2015 - 2017

Socio-ekonomické změny v Evriopě 90-tých letech přinesly mimo jiné i změny v látkovém koloběhu nutrientů obhospodařované krajiny. Cílem projektu je vysvětlit strukturální změny v přehradním potravním řetězci živiny- fytoplankton-zooplankton v podmínkách dlouhodobého poklesu zátěže fosforem a současně rostoucí zátěže rozpuštěným organickým uhlíkem z povodí.


Vliv slunečního záření na klíčové skupiny sladkovodních Betaproteobacteria

Číslo projektu: 15-09721S

Řešitel: Petr Porcal

Zdroj financování: Grantová Agentura ČR

Doba řešení: 2015 - 2017

Klíčovými hráči biogeochemických procesů, zodpovědnými zejména za transformaci rozpuštěných organických látek (DOM) ve vodách, jsou planktonní baktérie. Jednou z klíčových komponent sladkovodního bakterioplanktonu je skupina Betaproteobacteria obsahující dva klíčové taxony – rod Limnohabitans a druh Polynucleobacter. Oba taxony byly popsány jako vysoce početná součást bakterioplanktonu, rychle reagující na měnící se podmínky prostředí. V současnosti je všeobecně známo, že fotoprodukty, vzniklé při ozáření DOM světlem, ovlivňují růst bakterií. Tento projekt je zaměřen na rozšíření našich rychle se rozrůstajících znalostí dvou cílových bakteriálních skupin. Toho dosáhneme kombinací ozařovacích a inkubačních experimentů využívajících světově unikátní sbírky bakteriálních taxonů a našich odborných znalostí charakterizace DOM.


Odezvy fytoplanktonu na změny životního prostředí

Číslo projektu: 15-13750S

Řešitel: Petr Znachor

Zdroj financování: Grantová Agentura ČR

Doba řešení: 2015 - 2017

Sladkovodní jezera a nádrže jsou citlivými indikátory klimatických změn. Studium dlouhodobých časových řad ukazuje, že globální změna klimatu ovlivňuje fyziologii organismů, početnost populací a strukturu společenstev a potravních sítí. Ve vodních ekosystémech představuje fytoplankton základní článek potravního řetězce a jeho dynamika závisí na sezónních změnách teploty, míchání vodního sloupce, dostupnosti živin a žíru zooplanktonem. Všechny tyto procesy jsou změnou klimatu ovlivněny. V navrhovaném projektu chceme s použitím 30leté časové řady dat z nádrže Římov objasnit mechanismy zodpovědné za meziroční variabilitu fytoplanktonu. Budeme se zabývat zejména změnami načasování jednotlivých fází sezónního cyklu (fenologie) fytoplanktonu, který bude hodnocen na základě funkčních skupin.


Faktory ovlivňující fototrofní aktivitu společenstva sladkovodních Betaproteobakterií

Číslo projektu: 15-12197S

Řešitel: Vojtěch Kasalický

Zdroj financování: Grantová Agentura ČR

Doba řešení: 2015 - 2017


Změny izotopového signálu ryb: spojitost mezi využíváním krajiny a potravními sítěmi nádrží

Číslo projektu: 15-01625S

Řešitel: Mojmír Vašek

Zdroj financování: Grantová Agentura ČR

Doba řešení: 2015 - 2017

Ekologické funkce přírodních i umělých sladkovodních systémů jsou narušovány řadou antropogenních vlivů. Předložený projekt se zabývá hodnocením dopadů lidské činnosti v krajině na strukturu a fungování potravních sítí v ekosystémech přehradních nádrží. Studovány budou změny ve struktuře rybích společenstev a změny v izotopovém signálu rybích tkání
ve vybraných nádržích, jejichž povodí jsou různou měrou dotčena lidskou činností. Unikátní časové řady archivovaných vzorků rybích šupin budou podrobeny analýze obsahu stabilních izotopů uhlíku a dusíku. Očekáváme, že izotopový signál v rybích šupinách bude odrážet historické změny hospodářského využívání krajiny a intenzitu zatížení povrchových vod živinami. Vyhodnocen bude vliv antropogenní eutrofizace na změnu toků energie uvnitř potravních sítí vodních nádrží. Výsledky projektu osvětlí posuny ve struktuře a funkci vodních ekosystémů vyvolané lidskou činností a mohou být využity při tvorbě plánů ochrany krajiny, vodních zdrojů a povodí.


Toxický potenciál, evoluce syntézy toxinů a faktory řídící produkci anatoxinu-a bentických a půdních nostokálních sinic

Číslo projektu: 14-18067S

Řešitel: Eliška Zapomělová

Zdroj financování: Grantová Agentura ČR

Doba řešení: 2014 - 2016


Rozlišení vlivů změn v chemismu prostředí a klimatu na biogeochemické procesy a biodiversitu přírodních půd a vod alpinského pásma.

Číslo projektu: 14-09231S

Řešitel: Jiří Kopáček

Spoluřešitel: Přírodovědecká fakulta, Jihočeská Univerzita v Českých Budějovicích

Zdroj financování: Grantová Agentura ČR

Doba řešení: 2014 - 2016

Ve Vysokých Tatrách v současnosti probíhá svým rozsahem světově ojedinělé zotavování vodních a terestrických ekosystémů alpinské zóny z acidifikace díky unikátnímu poklesu depozice S (>60%) i N (40%) od roku 1989. Související změny biogeochemických procesů a biodiversity jsou však propleteny se souběžným vlivem výrazně rostoucí teploty. Rozlišení významnosti těchto vlivů je nezbytné pro předvídání dalšího vývoje přírodních ekosystémů vlivem očekávaných trendů znečišťování atmosféry a klimatu. Na základě dlouhodobého výzkumu této lokality navrhujeme integrovaný, multidisciplinární výzkum vlivu chemických a klimatických změn v přírodních alpinských ekosystémech, zahrnující jejich dopad na (i) rychlost zvětrávání, půdní chemismus, a odnosy živin (P, N a C), bazických kationtů a toxických forem Al do vod, (ii) procesy zodpovědné za imobilizaci P v jezerní vodě a sedimentech, (iii) biologické zotavování (fytoplankton, zooplankton a bentos) v jezerech a (vi) biodiversitu půd (mikrobiální složení a bezobratlí) podél gradientů půdního pH a nadmořské výšky (vegetačních zón a teploty).


Funkční diverzita půdních mikroorganismu rašelinné smrčiny a její vliv na DOM v půdě

Číslo projektu: 13-17398S

Řešitel: Tomáš Picek, Přírodovědecká fakulta, Jihočeská Univerzita v Českých Budějovicích

Spoluřešitel: Jakub Borovec

Zdroj financování: Grantová Agentura ČR

Doba řešení: 2013 - 2016


Vliv přirozeného rozpadu horských smrkových porostů na mikroklima

Číslo projektu: P504/12/1218

Řešitel: Jiří Kopáček

Spoluřešitel: Přírodovědecká fakulta, Jihočeská Univerzita v Českých Budějovicích

Zdroj financování: Grantová Agentura ČR

Doba řešení: 2012 - 2016

Polomy a klimatické faktory přispěly k rozvoji kůrovce (Ips typographus) a velkoplošnému odumírání smrkových (Picea abies) porostů v bezzásahových oblastech Šumavy. V letech 2004–2007 zahubil kůrovec >90% smrků v povodí Plešného jezera. Polomy poškodily porosty i v povodí Čertova jezera a Laky. Všechna tato území jsou dlouhodobě intenzivně studována. Tento ekologický výzkum probíhá nepřetržitě od let 1984–2002 a postupně zahrnoval vodu, klima, půdu a les. Dostupné datové řady před nástupem kalamit, náš současný výzkum i nové studie navržené projektem nabízí celosvětově unikátní možnost komplexního ekologického výzkumu a zhodnocení dopadů přirozeného rozpadu lesa na jednotlivé složky horských ekosystémů. Navrhujeme 3 okruhy studií, zahrnující: (1) změny látkových toků a zásob prvků v celém ekosystému (porost, podrost, půda, voda), (2) zhodnocení dopadů kalamit na mikroklima, hydrologii, chemismus a biodiversitu půd a vod a (3) modelování těchto dopadů prostorově (pro další horské oblasti a typy lesního hospodaření) i časově (pro očekávané změny klimatu a znečištění atmosféry).


Hydroakustické rozlišení ryb od bublin a kvantifikace emisí methanových bublin z přehrad mírného pásma

Číslo projektu: P504/12/1186

Řešitel: Jaroslava Frouzová

Spoluřešitel: Petr Stanovský, Institute of Chemical Process Fundamentals of the ASCR, v. v. i.

Zdroj financování: Grantová Agentura ČR

Doba řešení: 2012-2015

Akustické parametry stoupajicích methanových bublin budou měřeny pomoví sonarů operujích na různých frekvencích pro uměle vztvořené bubliny. Bude vytvořen speciální algoritmus využívající multifrekvenční záznam pro rozlišení ozvěn bublin od ryb se stejnou akustickou velikosti. Tato metoda bude použita pro zpřesnění odhadů množství ryb a biomasy. Dále bude modifikovám model popisující stoupání a rozpouštění bublin pro případ sladkovodních reservoárů. Vztah mezi objemem bublin a akustickou ozvěnou z experimentů s uměle vytvořenými bublinami bude použit pro získání přesnějších dat o objemu methanových bublin emitovaných ze zkoumaných reservoárů v temperátní zóně. Prostorovo-časové změny v jejich tvorbě budou studovány také. V konečném výsledku by projekt měl osvětlit vztahy mezi kvantitou a kvalitou emitovaných methahových bublin a podmínkách prostředí.


Odejdi! naznačila: sexuální segregace sladkovodních ryb

Číslo projektu: P505/12/P647

Řešitel: Marie Prchalová

Spoluřešitel:

Zdroj financování: Grantová Agentura ČR

Doba řešení: 2012-2014

Segregace pohlaví je běžný jev vyskytující se napříč živočišnou říší. U sladkovodních ryb je tento jev zatím jen málo prozkoumán. Paví očko je jediným vodním organismem, u kterého byly hypotézy o pohlavní segregaci ověřovány. V rámci předkládaného projektu budeme zkoumat segregaci pohlaví u pěti nejběžnějších druhů ryb stojatých vod Evropy. Pomocí vzorkování tenaty a výpočtu segregačního koeficientu zjistíme, zda jsou ryby segregované a jak (segregace v habitatech vs. po lokalitách). Budou testovány tři možné důvody pro segregaci, a to predační tlak, teplota vody a dostupnost potravy. Dále se zaměříme na pohlavní dimorfismus cílových druhů ryb. Parametry jako přežívání, růst, kondice, délko-váhový vztah a morfologie žaberního aparátu budou porovnávány mezi pohlavími. Samice cílových druhů mohou být aktivnější a mohou mít vyšší kondici než samci, což ovlivní representativnost vzorků pořízených tenaty. Proto počítáme s jednoduchým experimentem, kdy v pronajatém rybníce budeme lovit tenaty v naprosto známé rybí obsádce, co se poměru pohlaví a kondice všech jedinců týká.


Kompetiční mechanismy u sinic ovlivňující druhové složení fytoplanktonu

Číslo projektu: 206/09/0309

Řešitel: RNDr. Klára Řeháková, Ph.D., Biologické centrum AV ČR, v.v.i.

Spoluřešitel: RNDr. Ondřej Komárek, PhD., Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích

Zdroj financování: Grantová Agentura ČR

Doba řešení: 2009-2013

Fytoplankton nádrží a jezer je intenzivně studován již desetiletí. Jeho významnou složkou jsou sinice, které často v eutrofních nádržích vytvářejí vodní květy. Při přemnožení sinic může docházet k uvolňování toxinů, které jsou nebezpečné pro zdraví člověka a zvířat, zároveň dochází k vyčerpání kyslíku z vody a jeho nedostatek může způsobit hospodářské škody na rybí osádce a narušit fungování celého ekosystému. Z těchto a mnoha dalších důvodů je nutné věnovat studiu biologie vodních květů značnou pozornost. Předkládaný projekt by se zaměřil na kompetiční vztahy mezi sinicovými dominantami a subdominantami vodního květu. Jak jejich vzájemné
spolupůsobení může ovlivnit jejich fyziologické a biochemické charakteristiky? Jak tyto změny mohou ovlivnit jejich schopnost stát se dominantním druhem vodního květu? Projekt je unikátní spojení taxonomického, biochemického a
fyziologického přístupu k biologii sinic vodních květů.


Únikové strategie před predátory u časných vývojových stádií okounovitých ryb

Číslo projektu: 206/09/P266

Řešitel: Martin Čech

Spoluřešitel:

Zdroj financování: Grantová Agentura ČR

Doba řešení: 2009-2011

Projekt je zaměřen na únikové strategie před predátory u časných vývojových stádií okounovitých ryb ve stratifikované kaňonovité nádrži, v nestratifikované mělké nádrži a v zatopené důlní jámě. Zabývá se novým poznatkem, že plůdek okounovitých ryb je schopen vytvářet sympatrické ekologické skupiny s různým chováním. Předpokládá se, že jde o excelentní strategii druhu vyhnout se predačnímu tlaku, který může být různé úrovně v různých prostředích a v různých vodních tělesech. Zvláštní pozornost bude věnována nově objevené komunitě bathypelagického plůdku okounovitých ryb ve stratifikované nádrži, která se nejpravděpodobněji v nestratifikované nádrži mění na komunitu bentického plůdku a v zatopené důlní jámě na plůdkovou komunitu schovanou v hustých zárostech vegetace. Efektivita jednotlivých strategií bude zhodnocena s využitím nejrůznějších nových přístupů, včetně vědeckých sonarů (SIMRAD), akustické (DIDSON) a podvodní kamery ke sledování chování kořisti i predátorů a SCUBA potápěčů pro kvantitativní vzorkování plůdku v husté vegetaci.


 

Horizontal acoustic surveys and fish behaviour in the open water

Číslo projektu: 206/07/1392

Řešitel: Jan Kubečka

Spoluřešitel:

Zdroj financování: Grantová Agentura ČR

Doba řešení: 2007-2010

Most fish of the open water of large reservoirs of Czech Republic (also applies to many lakes and reservoirs worldwide) inhabit surface layers where they can be studied quantitatively preferably by horizotal acoustic surveys. The aim is to solve main persistent problems of horizontal surveying like undefined behaviour of ultrasonic field, uncertainty of fish size estimates, microdistribution, discrimination between small fish and bubbles, influences of swimming behaviour and diurnal changes of behaviour. The emphasis is on improvement of quality of mobile surveys with large spatial coverage. The problems will be solved by the combination of (i) klassical split-beam echosounder, (ii) newest commercially available high frequency multibeam sonar Didson, which has theoretically a number of advantages (iii) direct fishing and optical approaches. Project should significantly improve horizontal detection of fish, interpretation of records and elucidate a number of patterns of pelagic behavoir of fish which is insufficiently known in fresh waters.


Vzorce a důvody rozdílného pelagického chování plůdku okouna: nový pohled na deklarovanou ekologickou plasticitu druhu

Číslo projektu: 206/06/1371

Řešitel: Martin Čech

Spoluřešitel:

Zdroj financování: Grantová Agentura ČR

Doba řešení: 2006-2008

Projekt je zaměřen na pochopení ekologické diferenciace plůdku okouna říčního, kdy se stejný ročník rozpadá na epipelagický (EPF) a bathypelagický (BPF) plůdek. EPF žije stále v epilimniu nádrží, zatímco BPF každodenně migruje mezi epilimniem a hypolimniem. Cílem je přesněji definovat nově objevené ekologické skupiny, časoprostorové zákonitosti jejich separace a důvody diferenciace, zjistit výhodnost a sezónní osud těchto skupin, podněty diurnálních migrací, úmrtnost plůdku vlivem predace a změny abundance, věkového a velikostního složení na podélném profilu nádrží s ohledem na množství vytřených jiker. Bude rozpracováno rozsáhlé sledování pomocí síťových, hydroakustických, potápěčských, molekulárně genetických, histologických, parasitologických a dalších metod. Vnitrodruhová diferenciace pelagického plůdku bude sledována i u candáta a ježdíka obecného takže bude možno zevšeobecnit některé rysy chování v rané ontogenezi okounovitých ryb.


Kompetiční vztahy mezi dominatními druhy fytoplanktonu údolních nádrží

Číslo projektu: 206/06/0462

Řešitel: RNDr. Klára Kaštovská, PhD

Spoluřešitel:

Zdroj financování: Grantová Agentura ČR

Doba řešení: 2006-2008

V posledních letech se naše přehrady potýkají s problémem eutrofizace a s ní spojeným masovým rozvojem sinicových vodních květů a jejich toxicitou. Vodní květy způsobují mnoho problémů hygienických, zdravotních a zhoršují kvalitu pitné vody v nádržích. I přesto, že je této problematice věnována značná pozornost, stále je mnoho nevyřešených otázek týkajících se rozvoje a druhového složení vodních květů. Z těchto důvodů je nutné co nejpodrobněji poznat biologii vodních květů, mechanismy ovlivňující jejich rozdílné druhové složení v jednotlivých letech a vzájemné kompetiční vztahy mezi jednotlivými druhy sinic. Předkládaný projekt by se věnoval studiu dominantních sinic a řas tvořících vodní květ, jejich ekologickým nárokům, růstovým optimům a kompetičním vztahům mezi jednotlivými dominantami. Zároveň by studoval fyzikálně-chemické a biologické faktory, které mohou výskyt jednotlivých dominant ovlivňovat jak v laboratorních tak v přírodních podmínkách.


Sezónní dynamika příjmu potravy, růstu a produkce rybího plůdku a jeho predační vliv na zooplankton v údolní nádrži s trofickým gradientem

Číslo projektu:  206/06/P418

Řešitel: Mojmír Vašek

Spoluřešitel:

Zdroj financování: Grantová Agentura ČR

Doba řešení: 2006-2008

Dynamika populací a společenstev rybího plůdku byla studována v eutrofní korytovité nádrži (VN Římov) v průběhu dvou sezón (2006 a 2007), které se výrazně lišily hydrologickými a teplotními podmínkami. Ve společenstvech plůdku hrázové a přítokové oblasti nádrže převažovali stejní zástupci okounovitých a kaprovitých ryb. Okounovité ryby tvořily na počátku růstové sezóny hlavní složku pelagického plůdku. V průběhu sezóny se okounovité ryby přesouvaly do litorálu. Opačný trend v sezónním využívání habitatů byl zjištěn u plůdku kaprovitých ryb. Míra přežívání plůdku byla vyšší v sezóně se zatopenou terestrickou vegetací v pobřežním pásu (r. 2006). V nadprůměrně teplém roce 2007 probíhal vývoj plůdku výrazně rychleji. Kvantifikovány byly rozdíly v růstových rychlostech dominantních druhů plůdku mezi hrázovou (méně úživnou) oblastí a přítokovou (více úživnou) oblastí nádrže. Plůdek se živil převážně zooplanktonem po celé vegetační období. Pomocí bioenergetického modelování byla stanovena míra predačního tlaku plůdkového společenstva na filtrující zooplankton rodu Daphnia v klíčovém období sezónního cyklu. Predační vliv plůdkového společenstva byl příliš malý na to, aby řídil populační dynamiku zooplanktonu Daphnia ve studované nádrži. V průběhu řešení projektu byla nasbírán cenný materiál umožňující obsáhlý popis časoprostorové dynamiky distribuce, početnosti, růstu a produkce ranných vývojových stádií ryb v ekosystému velké údolní nádrže s výrazným podélným gradientem úživnosti.


Grantová agentura Akademie věd ČR

Vliv kvantity a kvality potravy na změnu kompetiční úspěšnosti mezi 0+ okounem a ploticí

Číslo projektu: KJB600960810

Řešitel: Jiří Peterka

Spoluřešitel:

Zdroj financování: Grantová agentura Akademie věd ČR

Doba řešení: 2008-2010

0+ okoun a plotice dominují plůdkovému společenstvu meso- a eutrofních evropských nádrží. S nárůstem produktivity nádrží byl zaznamenán obecný přechod od dominance okouna k dominanci plotice a to jak porovnáním plůdkových společenstev jezer a nádrží s různou trofií, tak porovnáním 0+ společenstev nádrží s odlišnými trofickými poměry na podélném profilu. Vyšší kompetiční úspěšnost 0+ plotice ve vztahu k planktonním korýšům (Cladocera i Copepoda) je považována za příčinu těchto změn v dominanci obou druhů. Na druhou stranu byla však v poslední době výrazná efektivita plotice oproti okounovi zpochybněna. Cílem předkládaného projektu je manipulativními experimenty objasnit vliv vnitro- a mezidruhové potravní kompetice mezi 0+ ploticí a okounem, a zejména zjistit vliv kvantity a/nebo kvality potravy (druh a velikost kořisti, načasování změn potravních zdrojů atd.) na změny v kompetiční úspěšnosti (vyhodnocované jako rychlost růstu) mezi oběma druhy ryb.


Akademie věd ČR

Strategie AV21 - Rozmanitost života a zdraví ekosystémů - Aktivita: Monitoring indikačních, krypticky žijících druhů ryb šetrnými metodami

Číslo projektu: 580300/991100

Řešitel: Petr Blabolil

Spoluřešitel:

Zdroj financování: Akademie věd ČR

Doba řešení: 2015-2016

V době měnících se podmínek prostředí je klíčový monitoring organismů reflektujících tyto změny. Rozličné změny v krajině na škále od způsobu hospodaření v povodí až po globální změnu klimatu jsou obzvláště patrné ve vodních ekosystémech. Jednou z nejcitlivějších skupin je rybí obsádka integrující nižší složky trofického řetězce. V současné době je pozornost věnována především dominantním druhům ryb, pro které je rozpracována metodika detekce síťovými odlovy. Krypticky žijící ryby citlivé na změny prostředí jsou kvůli obtížnější ulovitelnosti často opomíjeny. Projekt si klade za cíl vytvoření a ověření monitorovacího schématu za využití šetrných metod (odlovy vězenci a elektrickým agregátem spolu s vizuálním průzkumem potápěči) krypticky žijících druhů v ekosystémech přehradních nádrží. Jako modelové druhy budou využity mník jednovousý (Lota lota) a sekavec podunajský (Cobitis elongatoides). Tyto druhy jsou nejen dobrými indikátory kvality prostředí, distribuce těchto druhů indikuje dostupnost obyvatelného prostředí pro většinu organismů v nádrži (především hlubší vrstvy), ale jedná se i o druhy uvedené v seznamu zvláště chráněných organizmů a šetrný a neinvazivní monitoring je tak více než žádoucí. Získané údaje o populační struktuře sledovaných populací budou poskytnuty správcům a hospodářům na nádržích i orgánům ochrany přírody a krajiny. Ověřené monitorovací schéma bude aplikovatelné i na komerčně významné druhy s podobnými životními strategiemi, které jsou předmětem zájmu například rybářských organizací.

KONTAKT

Biologické centrum AV ČR, v.v.i.
Hydrobiologický ústav
Na Sádkách 702/7
370 05 České Budějovice

NAJÍT PRACOVNÍKA