RNDr. Jan Mareš, Ph.D.

Funkce: Postdoktorand - Oddělení mikrobiální ekologie vody

Kontaktní údaje

Telefon: 387775886
E-mail: jan.mares@centrum.cz
Místnost: 032

Popis

Dlouhodobě se zabývám problematikou diverzity, rozšíření, ekologie a taxonomie sinic. Zejména se specializuji na objasnění molekulární fylogeneze a evoluce sinic, analýzu jejich genomů a genetického potenciálu pro syntézu toxinů a jiných biologicky aktivních látek. Kromě základního výzkumu se podílím též na výzkumu s potenciálem pro využití v praxi hydrobiologického monitoringu (identifikace druhů sinic, ekotoxikologický monitoring), a dále na charakterizaci nových přírodních produktů izolovaných ze sinic, potenciálně využitelných např. ve farmacii a zemědělství (antibiotika, fungicidy).

Odborný životopis

NAROZEN:  27. ledna 1984, Hradec Králové
 
VZDĚLÁNÍ:
• 2009–2015: Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, Přírodovědecká fakulta
                         Doktorský studijní program Botanika, specializace Fykologie
Disertační práce: Polyfázický přístup k taxonomii vybraných zástupců sinic.
 
ODBORNÉ ZÁJMY
Evoluce, taxonomie a rozšíření sinic (řas), molekulární fylogenetika, genomika a bioinformatika.
 
VĚDEČTÍ ZAMĚSTNAVATELÉ
• Biologické centrum AVČR, v.v.i., Hydrobiologický ústav (od r. 2014)
• Botanický ústav AVČR, v.v.i. (od r. 2011)
• Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, Přírodovědecká fakulta (2010, od r. 2012)
• IMikrobiologický ústav AVČR, v.v.i. (od r. 2013)
 
OSTATNÍ ZAMĚSTNÁNÍ
• Povodí Vltavy, s.p. - hydrobiolog (2008 – 2012)
 
GRANTY
• 2014-2016 GA ČR 16-09381S: „Bioactive cyanobacterial lipopeptides: genome mining, detection, and structure-activity relationships “, spoluřešitel
• 2014-2016 GA ČR 14-18067S „Toxic potential, evolution of toxin synthesis, and factors driving anatoxin-a production in benthic and soil nostocacean cyanobacteria“, člen týmu
• 2012-2014 MŠMT AMVIS/KONTAKT II LH12100 „ Diversity of cyanobacteria from tropical and subtropical biomas“, člen týmu
• 2012- 2014 GA ČR P506/12/1818 „Phylogenetic and phenotypic evaluation of heterocytous cyanobacteria from the family Scytonemataceae”, člen týmu
• 2011 doctoral grant of the Institute of Physical Biology (Univ. South Bohemia) "Multilocus sequence analysis as a tool for robust phylogeny in  heterocytous cyanobacteria", řešitel
• 2010 GA ČR 206/08/0318 „Phylogenetic relations, diversity and ecology of heterocytous cyanobacteria with polarised thalus”, člen týmu

Výuka Fykologické determinační praktikum
Jihočeská univerzita v Č. Budějovicích, Přírodovědecká fakulta
Popis:

Kurz je plánován jako blokový, s 5ti denním pobytem v zajímavé algologické lokalitě. Poslední den pobytu je koncipován jako shrnující přednáška základních typů řas a sinic, které se na lokalitě vyskytovaly. Obsahem cvičení je determinace sinic a řas ve vzorcích z různých biotopů (toky a stojaté vody různých typů, aerofytická stanoviště), které student sám získá. Cílem je podstatně rozšířit determinační schopnosti studentů při práci se vzorky řas a sinic z nejrůznějších typů biotopů.



Publikace
Celkem nalezeno: 15 záznamů
Galica T., Hrouzek P., Mareš J. (2017) Genome mining reveals high incidence of putative lipopeptide biosynthesis NRPS/PKS clusters containing fatty acyl-AMP ligase genes in biofilm-forming cyanobacteria Journal of Phycology 53 : 985-998.
DOI: 10.1111/jpy.12555
Johansen J., Mareš J., Pietrasiak N., Bohunická M., Zima J., Štenclová L., Hauer T. (2017) Highly divergent 16S rRNA sequences in ribosomal operons of Scytonema hyalinum (Cyanobacteria) PLoS ONE 12 : e0186393.
DOI: 10.1371/journal.pone.0186393
Saber A.A., Cantonati M., Mareš J., Anesi A., Guella G. (2017) Polyphasic characterization of Westiellopsis prolifica (Hapalosiphonaceae, Cyanobacteria) from the El-Farafra Oasis (Western Desert, Egypt) Phycologia 56 : 697–709.
DOI: 10.2216/16-107
Shalygin S., Shalygina R., Johansen J., Pietrasiak N., Berrendero E., Bohunická M., Mareš J., Sheil C. (2017) Cyanomargarita gen. nov. (Nostocales, Cyanobacteria): convergent evolution resulting in a cryptic genus Journal of Phycology 53 : 762–777 .
DOI: 10.1111/jpy.12542
Voráčová K., Hájek J., Mareš J., Urajová P., Kuzma M., Cheel J., Villunger A. , Kapuscik A., Bally M., Novák P., Kabeláč M., Krumschnabel G. , Lukeš M., Voloshko L., Kopecký J., Hrouzek P., Hrou (2017) The cyanobacterial metabolite nocuolin A is a natural oxadiazine that triggers apoptosis in human cancer cells. PPLoS ONE 12 : e0172850.
DOI: 10.1371/journal.pone.0172850
Hrouzek P., Voráčová K., Kuzma M., Hájek J., Urajová P., Cheel H., Mareš J., Lukešová A., Voloshko L., Pinevich A., Kopecký J., Villunger A. (2016) Izolovaný sinicový kmen Nostoc sp. a izolovaný sinicový kmen Nodularia, sinicový metabolit, způsob přípravy sinicového metabolitu a použití sinicového metabolitu jako léčiva Vlastník: Mikrobiologický ústav AV ČR v.v.i. - Biologické centrum AV ČR, v.v.i. - Saint-Petersburg State University. Datum udělení patentu: 30.03.2016. Číslo patentu: 305944
Mareš J., Cantonati M. (2016) Phylogenetic position of Geitleribactron purpureum (Synechococcales, Cyanobacteria / Cyanophyceae) and its implications for the taxonomy of Chamaesiphonaceae and Leptolyngbyaceae. Fottea 16 : 104–111.
DOI: 10.5507/fot.2016.002
Rosen B., Mareš J. (2016) Catalog of microscopic organisms of the Everglades, Part 1—The cyanobacteria. U.S. Geological Survey Open-File Report 2016 –1114, 108 p., DOI: 10.3133/ofr20161114
Bohunická M., Mareš J., Hrouzek P., Urajová P., Lukeš M., Šmarda J., Komárek J., Gaysina L. A., Strunecký O. (2015) A combined morphological, ultrastructural, molecular, and biochemical study of the peculiar family Gomontiellaceae (Oscillatoriales) reveals a new cylindrospermopsin producing clade of cyanobacteria. Journal of Phycology 51 : 1040–1054.
DOI: 10.1111/jpy.12354
Kust A., Kozlíková E., Mareš J., Řeháková K. (2015) A detailed morphological, phylogenetic and ecophysiological analysis of four benthic Anabaena (Nostocales, Cyanobacteria) strains confirms deep heterogeneity within the genus. Fottea 15 : 191–202.
DOI: 10.5507/fot.2015.019
Mareš J., Hájek J., Urajová P., Kopecký J., Hroužek P. (2014) A hybrid non-ribosomal peptide/polyketide synthetase containing fatty-acyl ligase (FAAL) synthesizes the ?-amino fatty acid lipopeptides puwainaphycins in the cyanobacterium Cylindrospermum alatosporum. PLOS ONE 9 : e111904..
Řeháková K., Mareš J., Lukešová A., Zapomělová E., Bernardová K., Hroužek P. (2014) Nodularia (Cyanobacteria, Nostocaceae):a phylogenetically uniform genus with variable phenotypes. Phytotaxa 172 : 235–246..
Řeháková K., Mareš J., Lukešová A., Zapomělová E., Bernardová K., Hroužek P. (2014) Nodularia (Cyanobacteria, Nostocaceae): A phylogenetically uniform genus with variable phenotypes Phytotaxa 172 : 235-246.
Hroužek P., Lukešová A., Mareš J., Ventura S. (2013) Description of the cyanobacterial genus Desmonostoc gen. nov. including D. muscorum comb. nov. as a distinct, phylogenetically coherent taxon related to the genus Nostoc Fottea 13 : 201-213.
Kaštovský J., Hauer T., Mareš J., Krautová M., Bešta T., Komárek J., Desortová B., Heteša J., Hindáková A., Houk V., Janeček E., Kopp R., Marvan P., Pumann P., Skácelová O., Zapomělová E. (2010) A review of the alien and expansive species of freshwater cyanobacteria and algae in the Czech Republic. Biological Invasions 12 : 3599–3625..

KONTAKT

Biologické centrum AV ČR, v.v.i.
Hydrobiologický ústav
Na Sádkách 702/7
370 05 České Budějovice

NAJÍT PRACOVNÍKA